Das Kompetenzzentrum Förderprogramme an der FüAk ist für die Zulassung der Lieferanten im EU-Schulprogramm und die verwaltungstechnische Abwicklung des EU-Schulprogramms in Bayern zuständig.

Die Verbundberatung ist die vertraglich geregelte Zusammenarbeit von anerkannten nicht-staatlichen Beratungsanbietern mit der staatlichen Beratung. Sie basiert auf dem Bayerischen Agrarwirtschaftsgesetz. Dienstleister, die sich als Beratungsunternehmen im Rahmen der Verbundberatung anerkennen lassen wollen, reichen die entsprechenden Unterlagen bei der FüAk ein.

Die Zentrale Vergabestelle an der FüAk führt alle EU-weiten Ausschreibungen für die Dienststellen im Geschäftsbereich des Staatsministeriums durch. Zudem werden Rahmenvereinbarungen für Liefer- und Dienstleistungen abgeschlossen.